近日,我校李钧敏教授国际合作团队在知名期刊《Horticulture Research》(中科院一区TOP,五年影响因子8.2,入选中国科技期刊卓越行动计划领军类期刊)上在线发表题为“Genomic data provides insights into the evolutionary history and adaptive differentiation of two tetraploid strawberries”的研究论文,团队林汉扬副教授为论文第一作者,李钧敏教授为通讯作者,台州学院为第一单位。
多倍体植物与其二倍体祖先间的生态位进化式样及其遗传背景是生态学领域长期关注的议题。该论文以蔷薇科草莓属(Fragaria)植物为研究对象,组装了伞房草莓等五种野生草莓的染色体级别全基因组,聚焦两个我国特有的四倍体物种伞房草莓(F. corymbosa)和西南草莓(F. moupinensis)开展了相关研究。全基因组数据显示,二倍体中国草莓是四倍体伞房草莓最有可能的祖先,而四倍体西南草莓的祖先可能是未被采样的中国草莓群体或已灭绝的中国草莓近缘物种;同时,二倍体草莓物种间存在广泛的基因渐渗。结合转录组数据,该研究发现四倍体物种较之其二倍体祖先在与紫外线辐射、DNA修复等相关基因中呈现出基因家族扩张和转录水平上升,而在与各类胁迫响应相关的基因中显示出基因家族收缩和转录水平下降,为该热点议题提供了重要的分子遗传学启示。
该项研究得到了国家自然科学基金委员会(NSFC)与美国国家科学基金会(NSF)中美生物多样性专项的资助。美国匹兹堡大学Tia-Lynn Ashman教授、美国俄勒冈州立大学Aaron Liston教授、杭州师范大学董鸣教授等参与指导了该项研究。
论文链接:https://doi.org/10.1093/hr/uhae194